Les Îles de Jarre et de Jarron sont deux Îles presqu'attenantes qui doivent leur nom du fait d'avoir longtemps été utilisées pour la production de sel, obtenu par évaporation de l'eau de mer réservée dans des jarres, ce qui explique le nombre impressionnant de jarres que l'on a pu y retrouver.
À partir de 1625, les bateaux "à problèmes" [possiblement véhicules d'infections pathogènes] étaient amarrés pour mise en quarantaine dans la Calanque de Jarron, entre les Îles de Jarre et de Jarron, et l'on peut encore y retrouver les nombreuses bites d'amarrage qui étaient alors utilisées pour immobiliser les bateaux. Le plus célèbre de ces bateaux mis en quarantaine à Marseille est le "Grand St-Antoine", le voilier qui ramena la peste de Syrie en 1720. Il fut brûlé, coulé et son épave calcinée fut retrouvée en 1978 par une association de plongeurs. On repêcha son ancre en 1982 pour la restaurer en 2012, et elle est à présent installée à l'entrée du Musée d'Histoire de Marseille, au Centre Bourse.
Sur l'Île de Jarre, on peut retrouver la "Baume des Morts", la grotte où l'on jetait les cadavres des victimes infectées, que l'on recouvrait de chaux.
L'Île de Jarre est aussi dotée sous son flanc Sud de trois grottes sous-marines, les Grottes "Arc en Ciel", "Mystérieuse" et "Sans Fond".